בית המשפט קבע מבחנים לבחינת השאלה האם המשכיר הוא "צינור" שדרכו נערכת התקשרות השכרה למגורים בין המשכיר לבין שוכר המשנה, שעמידה בהם תפטור את העסקה ממע"מ. במידה ואין עמידה במבחנים, תחול חבות מע"מ על ההפרש בין הוצאות השכירות להכנסות.

ככל וחלה חבות במס בשל התקבולים השוטפים הניתנים לעוסק, הרי ששיעור המס החל על המענקים יהיה בהתאם לשיעור המס החל על עסקאותיו השוטפות של העוסק שבשלהן ניתנו לו המענקים.

כאשר התייר משלם ישירות לרופא אך התמורה כלולה בשובר קבלה/חשבונית/ חשבונית מס שהוציא בית החולים לתייר , השירותים יחשבו כשירותים נוספים הניתנים לתייר אגב אשפוזו, ולפיכך יחויבו במע"מ בשיעור אפס.

בתיקון לתקנות מע"מ שנכנס לתוקף ביום 1.1.16 הוחרג מחייבי המס צרכן חשמל, שכל עסקאותיו הן מכר חשמל שהופק במערכת פוטו-וולטאית או טורבינת רוח, שמחזור עסקאותיו אינו עולה על 18,000ש"ח.

אין בעצם הרישום כעוסק כדי להביא בהכרח למסקנה כי מתנהל עסק בידי האזרח, כאשר הטענה להעדר עסק מועלית על ידי האזרח עצמו אשר ביקש את הרישום. הרישום כשלעצמו איננו מקים חזקה ראייתית וברורה לכך שהפעילות מגיעה לכדי עסק.

מיום 1 בינואר 2014 עוסק המפיק חשבונית מס בסכום של 5,000 ₪ ומעלה (כולל מע"מ), נדרש לרשום בחשבונית שהוא מוציא את מספר הרישום במע"מ של הקונה או מקבל השירות .

בהתאם לסעיף 30 (א) (5) לחוק מע"מ ותקנות 12 ו- 12 א' לתקנות מע"מ, יחול מע"מ בשיעור אפס על השירותים הניתנים ע"י תושב ישראל לתושב החוץ, וזאת בהתקיים מספר תנאים:

במטרה לסייע ליצרנים קטנים, נקבע בתיקון לחוק מע"מ, שיצרנים שמחזורם השנתי הוא עד 1,950,000 ₪ יוכלו לדווח במשך שנה מיום פרסום החוק לפי בסיס מזומן,

בכל מקרה שמקבלים חשבונית מספק בקשיים – לפני שמשלמים לו את המע"מ, יש לוודא שאכן הספק שילם את מע"מ העסקאות, אחרת עלול מע"מ שלא להכיר במס התשומות ששולם.

סעיף 47א(ב) לחוק מע"מ, קובע כי על הרוכש טובין בסכום של 20,000 ₪ ומעלה מוטלת החובה לדרוש מהמוכר שהוא עוסק מורשה, חשבונית מס; ונוסף על זאת - נאסר עליו לשלם בשטרי כסף.

טבלת סכומים ושיעורים במע"מ לשנת 2008.

המחוקק לא הגדיר מהי "השכרה למגורים" – שכידוע פטורה מתשלום מ.ע.מ, אך הוא שלל את הפטור להשכרה של חדר במלון, בעלת אופי  מסחרי. השכרת צימר אינה השכרה של חדר במלון, אך מאידך, אינה לשם מגורים במובנם הרגיל.

עוסק המבקש לקזז מס תשומות, חייב לבדוק לגבי כל עוסק שהוא מתקשר איתו, כי יש לו תיק במשרדי מע"מ, וזאת אף אם הוצג לו אישור תקף לגבי ניכוי מס במקור!

גם אם למעביד צומחת הטבה מהתשומות בכך שהעובדים מתגוררים בסמוך לאתר העבודה, עדיין מדובר בטובת הנאה לעובד.

בפסק דין נוסף, קבע בית המשפט המחוזי כי אין לנכות מע"מ תשומות בגין ארוחות הנקנות על ידי העוסק בעבור עובדיו, אלא אם המעסיק מדווח על מכירת הארוחות לעובדים כעסקה החייבת במס

 ביהמ"ש פסק לאחרונה כי שאין לראות בהסכם פשרה משום "עסקה", שכן לא הוכח כי הועברה זכות כלשהי, ויש יסוד לטענה כי הסכומים שולמו כהחזר השקעה.